Stage M2 Influence des Processus à Fine Échelle dans la Dynamique de Cucumaria Frondosa H/F - Ifremer

Rejoignez l'Ifremer pour un océan mieux compris, mieux protégé qui demeure un allié du bien-vivre sur la planète

Des abysses à la surface, de la côte au large, l'Ifremer est l'institut de recherche français entièrement dédié à l'Océan. Ses équipes mènent des recherches, innovent et produisent des expertises pour protéger l'océan, exploiter ses ressources de manière responsable et partager les données marines.

L'Ifremer apporte son expertise scientifique pour éclairer les politiques publiques et élabore des solutions puisées dans l'océan pour répondre aux enjeux de la transition écologique. Opérateur de la Flotte océanographique française avec sa filiale d'armement Genavir, l'Ifremer imagine, conçoit et déploie des moyens technologiques de pointe pour percer les mystères de l'océan.

Rejoignez nos équipes, composées de 1500 scientifiques et métiers supports à la recherche, et présentes sur tout le littoral métropolitain et en Outre-mer.

www.ifremer.fr

Date limite de réception des candidatures : 12/11/2026

• Présentation de la structure de rattachement : Le stage est accueilli au laboratoire Ressources Halieutiques de l'Ifremer (unité HMMN), à la Station Ifremer de Port-en-Bessin. Ce laboratoire à taille humaine favorise de nombreuses interactions entre les équipes. Il porte un programme de recherche d'appui à la gestion de la pêcherie de concombre de mer (Cucumaria frondosa) de Saint-Pierre-et-Miquelon, fondé sur l'évaluation de la biomasse disponible à partir de suivis vidéo (campagnes HOLOTVSPM).
• Position dans l'organigramme : Stagiaire intégré·e à l'équipe du laboratoire Ressources Halieutiques (unité HMMN), au sein du projet d'évaluation de Cucumaria frondosa à Saint-Pierre et Miquelon.
• Rattachement hiérarchique : Stagiaire encadré·e par Aurel Hebert Burggraeve, Laurent Dubroca et Hubert Du Pontavice.

Mission - Finalité de l'emploi

Fiabiliser l'indicateur central du suivi de la pêcherie de concombre de mer (Cucumaria frondosa) de Saint-Pierre-et-Miquelon, indépendant de la pêche : la biomasse disponible estimée à partir de données vidéo sous-marines. Le stage teste d'abord l'effet du substrat, puis celui de la structure spatiale à fine échelle, sur l'estimation de la biomasse et de son incertitude. Il identifie ensuite les modèles de dynamique de population et les méthodes d'évaluation de la durabilité de l'exploitation les plus adaptés aux caractéristiques biologiques de l'espèce (mobilité limitée des adultes, croissance lente, longévité), puis les met en oeuvre dans des scénarios d'exploitation.

Contexte : la pêcherie, exploratoire en 2004 puis réglementée en 2008, a vu ses débarquements passer de 870 tonnes en 2012 à 1 810 tonnes en 2020, ce qui a conduit à la mise en place d'un total admissible de capture, d'une période de pêche saisonnière et d'une taille minimale de débarquement. Les estimations de biomasse issues des campagnes vidéo reposent sur des hypothèses de détectabilité et de répartition des individus, qui peuvent varier selon la nature du substrat et l'organisation spatiale de l'espèce à fine échelle.

Description des activités principales

• Renseigner le substrat à partir des données de la campagne HOLOTVSPM 2025 (annotation vidéo).
• Compléter le modèle d'estimation de la biomasse disponible en incluant la typologie du substrat et les informations disponibles sur les caractérisations des distributions individuelles (modèle linéaire généralisé à effets mixtes spatial et spatio-temporel selon le canevas sdmTMB)
• A partir d'une revue des méthodes existantes et de la littérature, sélectionner les modèles de dynamique de population et les méthodes d'évaluation de la durabilité de l'exploitation adaptés aux traits d'histoire de vie de l'espèce et aux données disponibles
• Mettre en oeuvre le modèle dans le cadre de scénarios d'exploitations simples.

Responsabilités exercées et latitude d'action

• Type de responsabilité : être garant·e de la qualité des traitements de données (annotation du substrat), des analyses statistiques et des simulations réalisés, et de leur restitution à l'équipe d'encadrement.
• Niveau d'autonomie : un profil méthodique et autonome est attendu ; le ou la stagiaire conduit les analyses dans le cadre défini avec l'équipe d'encadrement.
• Limites d'autonomie : les choix méthodologiques structurants (modèle de biomasse, modèles de dynamique de population, scénarios d'exploitation) sont discutés et validés avec les encadrants (Aurel Hebert Burggraeve, Laurent Dubroca, Hubert Du Pontavice).
  

• Compétences requises : savoir et savoir-faire
  • Maîtrise du langage de programmation R, avec une appétence prononcée pour les analyses numériques et la modélisation.
  • Intérêt pour les statistiques spatiales et pour la dynamique des populations exploitées.
  • Connaissances en écologie marine, halieutique, modélisation ou statistiques.

• Qualités, savoir-être
  • Profil méthodique et autonome.
  • Aptitude à travailler au sein d'un laboratoire à taille humaine, où les interactions entre équipes sont nombreuses.